机器学习算法——主成分分析（PCA）

本文介绍: 具体来说，第一主成分是数据中方差最大的特征（即该特征下的值的方差最大），数据点在该方向有最大的扩散性（即在该方向上包含的信息量最多）。第二主成分与第一主成分正交（即与第一主成分无关），并在所有可能正交方向中，选择方差次大的方向。然后，第三主成分与前两个主成分正交，且选择在其余所有可能正交方向中有最大方差的方向，以此类推，中，紫色线方向上数据的方差最大（该方向上点的分布最分散，包含了更多的信息量），则可以将该方向上的特征作为第一主成分。表示已经中心化后的值），协方差矩阵的计算（二维）

即为降维后的数据。

from sklearn.neural_network import MLPClassifier
from sklearn.datasets import load_digits
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.metrics import classification_report,confusion_matrix
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

# 载入手写体数据集并切分为训练集和测试集
digits = load_digits()
x_data = digits.data 
y_data = digits.target 
x_train, x_test, y_train, y_test = train_test_split(x_data,y_data)
x_data.shape

运行结果

(1797, 64)

# 创建神经网络模型，包含两个隐藏层，每个隐藏层的神经元数量分别为
# 100和50，最大迭代次数为500
mlp = MLPClassifier(hidden_layer_sizes=(100,50) ,max_iter=500)
mlp.fit(x_train,y_train)

# 数据中心化
def zeroMean(dataMat):
    # 按列求平均，即各个特征的平均
    meanVal = np.mean(dataMat, axis=0) 
    newData = dataMat - meanVal
    return newData, meanVal

# PCA降维，top表示要将数据降维到几维
def pca(dataMat,top):
    # 数据中心化
    newData,meanVal=zeroMean(dataMat) 
    # np.cov用于求协方差矩阵，参数rowvar=0说明数据一行代表一个样本
    covMat = np.cov(newData, rowvar=0)
    # np.linalg.eig求矩阵的特征值和特征向量
    eigVals, eigVects = np.linalg.eig(np.mat(covMat))
    # 对特征值从小到大排序
    eigValIndice = np.argsort(eigVals)
    # 从eigValIndice中提取倒数top个索引，并按照从大到小的顺序返回一个切片列表
    # 后一个 -1 表示切片的方向为从后往前，以负的步长（-1）进行迭代
    n_eigValIndice = eigValIndice[-1:-(top+1):-1]
    # 最大的n个特征值对应的特征向量
    n_eigVect = eigVects[:,n_eigValIndice]
    # 低维特征空间的数据
    lowDDataMat = newData*n_eigVect
    # 利用低纬度数据来重构数据
    reconMat = (lowDDataMat*n_eigVect.T) + meanVal
    # 返回低维特征空间的数据和重构的矩阵
    return lowDDataMat,reconMat

# 绘制降维后的数据及分类结果，共10个类
lowDDataMat, reconMat = pca(x_data, 2)
predictions = mlp.predict(x_data)
x = np.array(lowDDataMat)[:,0]
y = np.array(lowDDataMat)[:,1]
plt.scatter(x,y,c=y_data)

在这里插入图片描述

# 将数据降为3维
lowDDataMat, reconMat = pca(x_data,3)
# 绘制三维数据及分类结果，共10个类
x = np.array(lowDDataMat)[:,0]
y = np.array(lowDDataMat)[:,1]
z = np.array(lowDDataMat)[:,2]
ax = plt.figure().add_subplot(111, projection = '3d') 
ax.scatter(x, y, z, c = y_data, s = 10) #点为红色三角形